北京清华长庚医院肝胆胰中心成立于2014年11月，是亚洲第一个实体化整合式肝胆胰医学中心，也是国家“原发性肝癌规范化诊疗示范基地”，“大病不出县-国家级重点学科专项精准帮扶工程国家标准化肝胆肿瘤诊疗中心”牵头单位，中国研究型医院学会精准肝胆外科学院依托单位、中国肝癌联盟的副会长单位、中国医师协会智慧医疗专委会的会长单位，清华大学器官移植与仿生医学研究院主要承建部门之一，数智肝胆病学教育部重点实验室主要依托单位。中心集肝脏外科、胆道外科、胰腺外科、肝胆内科、重症肝病科、肝脏移植、肝胆胰肿瘤综合诊疗、肝胆肿瘤科、肝胆疾病介入治疗、儿童肝胆病诊疗、肝胆重症监护等相关专科于一体，以精准医疗和多学科诊疗模式为肝胆胰疾病患者提供“一站式”服务、系统化诊疗和全流程管理。中心以实体化整合式治理模式，在医疗服务、人才培养、科学研究等方面实现多专科协同发展。2024年10月，清华大学依托北京清华长庚医我院肝胆胰中心建立清华大学医学院肝胆胰中心。