北京清华长庚医院自2016年度起举办国家级、北京市级、区县级继续医学教育项目近千余场，部分项目已连续多年举办，如精准肝胆外科大师班、子宫内膜癌的筛查及早期诊断（子宫内膜细胞学技术培训班）、清华心血管病国际论坛、清华大学泌尿系结石论坛、睡眠相关疾病诊疗高级研修班暨睡眠医学清华论坛、个案管理师培训学习班等，有效提高学员业务素养，在专业领域占有一席之地。